19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0857 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  778    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  0.0121379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0385  hypothetical protein  29.64 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3424  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  30.64 
 
 		 381 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1553  hypothetical protein  28.14 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165231  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01680  hypothetical protein  30.75 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.607562  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1593  hypothetical protein  27.75 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  30.56 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4840  hypothetical protein  26.18 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6299  hypothetical protein  24.52 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0752  hypothetical protein  31.08 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0930  hypothetical protein  25.26 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3302  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  32.92 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.663366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1207  hypothetical protein  27.13 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.556738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5741  hypothetical protein  38.46 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.97 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  23.28 
 
 		 233 aa  47  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  27.42 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.37 
 
 		 233 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  29.91 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>