210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0601 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  100 
 
 
463 aa  929    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3191  cytochrome c oxidase, subunit I  74.13 
 
 
458 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  75.05 
 
 
467 aa  705    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  79.22 
 
 
465 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1980  cytochrome c oxidase, subunit I  71.68 
 
 
471 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  80.09 
 
 
465 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  75.44 
 
 
460 aa  695    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3115  cytochrome c oxidase, subunit I  76.96 
 
 
471 aa  731    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.86762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  70.64 
 
 
483 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2598  Nitric-oxide reductase  75.5 
 
 
460 aa  703    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605151  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  55.12 
 
 
448 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  55.8 
 
 
449 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  55.56 
 
 
448 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  55.22 
 
 
448 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  55 
 
 
448 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1516  Nitric-oxide reductase  53.19 
 
 
451 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2118  cytochrome c oxidase, subunit I  54.7 
 
 
447 aa  481  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  54.9 
 
 
462 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  55.8 
 
 
459 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0971  nitric-oxide reductase  54.13 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.838471  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0323  nitric oxide reductase large subunit, cytochrome b  53.71 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558101  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1968  cytochrome c oxidase, subunit I  53.49 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1849  cytochrome c oxidase, subunit I  52.46 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0823  nitric-oxide reductase subunit B  44.69 
 
 
456 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.112554  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  40.9 
 
 
457 aa  349  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2767  Nitric-oxide reductase  44.59 
 
 
457 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3435  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
457 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464275  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1255  nitric-oxide reductase subunit B  42.3 
 
 
463 aa  344  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  40.13 
 
 
457 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  43.75 
 
 
452 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  39.02 
 
 
474 aa  297  3e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  39.07 
 
 
481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  29.34 
 
 
787 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2253  Nitric-oxide reductase  28.48 
 
 
442 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  26.94 
 
 
739 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  28.14 
 
 
748 aa  139  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  28.63 
 
 
1077 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  26.41 
 
 
763 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  27.27 
 
 
773 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  25.46 
 
 
762 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  27.46 
 
 
773 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  27.21 
 
 
776 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.81 
 
 
758 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  26.97 
 
 
518 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.53 
 
 
761 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  26.97 
 
 
772 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  26.97 
 
 
772 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  26.97 
 
 
772 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  27.31 
 
 
758 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.31 
 
 
758 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  28 
 
 
756 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.34 
 
 
762 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  26.45 
 
 
763 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  28.7 
 
 
840 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  27.08 
 
 
762 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  26.24 
 
 
763 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  27.5 
 
 
762 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  27.08 
 
 
762 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  27.08 
 
 
762 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  25.93 
 
 
780 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  26.14 
 
 
780 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  27.08 
 
 
762 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  27.08 
 
 
762 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  27.08 
 
 
762 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  25.93 
 
 
767 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  27.7 
 
 
762 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  29.1 
 
 
763 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.78 
 
 
761 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  26.72 
 
 
764 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  28.64 
 
 
762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  27.48 
 
 
762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  28.21 
 
 
761 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  26.24 
 
 
763 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  28.29 
 
 
769 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.78 
 
 
761 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.9 
 
 
762 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  27.06 
 
 
762 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.02 
 
 
774 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  28.19 
 
 
769 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  26.6 
 
 
760 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  28.09 
 
 
758 aa  110  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  27.6 
 
 
763 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  26.67 
 
 
762 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  26.78 
 
 
761 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  24.43 
 
 
744 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  25.58 
 
 
761 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  25.96 
 
 
759 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  26.16 
 
 
783 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  26.16 
 
 
783 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  26.16 
 
 
783 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  26.65 
 
 
743 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  25.37 
 
 
758 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  29.22 
 
 
720 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  25.06 
 
 
756 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1520  nitric oxide reductase large subunit-like protein  24.15 
 
 
759 aa  99  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  23.81 
 
 
761 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4614  nitric oxide reductase large subunit-like protein  25.96 
 
 
756 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0294129  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1608  hypothetical protein  28.72 
 
 
746 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  25.27 
 
 
759 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5786  putative nitric-oxide reductase  25.89 
 
 
748 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>