15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1131 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1131  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  97.81 
 
 		 137 aa  259  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  25.93 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  30.37 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  29.37 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  29.41 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  25.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  25.71 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  25.74 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  26.12 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  27.08 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  26.17 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  26.17 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  25.23 
 
 		 152 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>