14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01230 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN01230  response to pH-related protein, putative  100 
 
 
968 aa  2016    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00239  Beige/BEACH domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09220)  38.68 
 
 
2483 aa  469  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.996444  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56356  predicted protein  42.77 
 
 
2283 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.614914 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41455  predicted protein  42.35 
 
 
366 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.291045  normal  0.0210228 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_813  predicted protein  39.95 
 
 
719 aa  278  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0197823  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13399  predicted protein  50.64 
 
 
252 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16408  predicted protein  48.21 
 
 
252 aa  231  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10805  predicted protein  43.44 
 
 
245 aa  198  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.689301  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9886  predicted protein  45.34 
 
 
231 aa  172  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86630  predicted protein  29.18 
 
 
1151 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.460388  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  38.81 
 
 
439 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40679  predicted protein  27.17 
 
 
376 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 
440 aa  45.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00627  FYVE domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17070)  36.51 
 
 
281 aa  44.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.805951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>