16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01580 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ01580  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  373  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  29.94 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  27.81 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01447  DNA-directed RNA polymerase III subunit 22.9 kDa, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04350)  34.41 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846477  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  28.31 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  31.76 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.26 
 
 
211 aa  48.5  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.418303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.69 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  27.37 
 
 
191 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  20.16 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  20.16 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  23.26 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  19.38 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  26.04 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  26.38 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  25 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.188149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>