22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG02920 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG02920  60S ribosomal protein L24 (L30), putative  100 
 
 
150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08704  60S ribosomal protein L24a (AFU_orthologue; AFUA_6G02440)  64.65 
 
 
160 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88185  predicted protein  59.05 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0390204  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19152  predicted protein  40.13 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43138  Ribosomal protein L24, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.59 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  40.43 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  36.56 
 
 
200 aa  72  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  35.48 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  36.56 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  35.05 
 
 
190 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  37.5 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  36.54 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1555  50S ribosomal protein L24e  36.67 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.953863  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  38.3 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  33.33 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1844  Ribosomal protein L24E  31.25 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00160492  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  38.89 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  34.62 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0752  Ribosomal protein L24E  30.77 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.643216  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  35.19 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1579  50S ribosomal protein L24e  37.04 
 
 
58 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1663  50S ribosomal protein L24e  31.67 
 
 
62 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>