15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE05380 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00010  conserved hypothetical protein  61.68 
 
 
1400 aa  1016    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03440  conserved hypothetical protein  59.86 
 
 
990 aa  1050    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02460  retrotransposable element slacs 132 kda protein (orf2), putative  65.22 
 
 
621 aa  853    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00010  hypothetical protein  90.95 
 
 
409 aa  763    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00100  retrotransposable element slacs 132 kda protein (orf2), putative  65.06 
 
 
621 aa  850    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.21893  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05190  conserved hypothetical protein  60.25 
 
 
1059 aa  1066    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05380  hypothetical protein  100 
 
 
938 aa  1943    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04940  hypothetical protein  62.74 
 
 
526 aa  702    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04710  hypothetical protein  62.36 
 
 
526 aa  695    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03020  hypothetical protein  62.93 
 
 
526 aa  705    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03030  hypothetical protein  65.38 
 
 
621 aa  855    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05710  hypothetical protein  86 
 
 
325 aa  432  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0653  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  21.52 
 
 
417 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.008692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1979  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  21.52 
 
 
417 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.312745  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.81 
 
 
469 aa  45.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>