17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00100 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ03440  conserved hypothetical protein  98.2 
 
 
990 aa  1238    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03030  hypothetical protein  99.03 
 
 
621 aa  1263    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03020  hypothetical protein  98.1 
 
 
526 aa  1067    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04710  hypothetical protein  98.67 
 
 
526 aa  1070    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04940  hypothetical protein  99.05 
 
 
526 aa  1075    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05380  hypothetical protein  65.06 
 
 
938 aa  834    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05190  conserved hypothetical protein  98.39 
 
 
1059 aa  1258    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00100  retrotransposable element slacs 132 kda protein (orf2), putative  100 
 
 
621 aa  1273    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.21893  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02460  retrotransposable element slacs 132 kda protein (orf2), putative  98.71 
 
 
621 aa  1258    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00010  conserved hypothetical protein  98.2 
 
 
1400 aa  1236    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00010  hypothetical protein  61.27 
 
 
409 aa  511  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05710  hypothetical protein  60.07 
 
 
325 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.28 
 
 
607 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.28 
 
 
607 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.28 
 
 
607 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.28 
 
 
607 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  21.12 
 
 
469 aa  43.9  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>