13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03030 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00010  conserved hypothetical protein  98.2 
 
 
1400 aa  1238    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03440  conserved hypothetical protein  98.2 
 
 
990 aa  1234    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02460  retrotransposable element slacs 132 kda protein (orf2), putative  98.39 
 
 
621 aa  1253    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00100  retrotransposable element slacs 132 kda protein (orf2), putative  99.03 
 
 
621 aa  1263    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.21893  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05190  conserved hypothetical protein  98.71 
 
 
1059 aa  1260    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05380  hypothetical protein  65.38 
 
 
938 aa  838    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04940  hypothetical protein  99.43 
 
 
526 aa  1078    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04710  hypothetical protein  98.67 
 
 
526 aa  1068    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03020  hypothetical protein  98.1 
 
 
526 aa  1063    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03030  hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1272    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00010  hypothetical protein  61.27 
 
 
409 aa  511  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05710  hypothetical protein  60.45 
 
 
325 aa  313  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  21.51 
 
 
469 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>