21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1681 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  96.77 
 
 		 417 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  28.89 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  36.36 
 
 		 428 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  35.29 
 
 		 428 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 421 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 433 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 438 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 421 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>