13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3405 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3405  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  329  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  31.06 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4730  Colicin V production protein  33.57 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  28.9 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1046  Colicin V production protein  26.16 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  30.43 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1130  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.242385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  31.2 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  31.97 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  25.32 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  25.85 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  27.88 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  31.9 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>