19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1997 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1997  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  319  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2421  hypothetical protein  49.33 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2919  hypothetical protein  43.62 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1250  protein of unknown function DUF450  44.52 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344127  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0461  protein of unknown function DUF450  40 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0367  protein of unknown function DUF450  40 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11283  hypothetical protein  39.31 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1526  hypothetical protein  36.55 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1807  protein of unknown function DUF450  35.71 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.648369  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0947  hypothetical protein  35.86 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.138847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1440  hypothetical protein  39.82 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0314502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0838  hypothetical protein  34.19 
 
 		 418 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  29.03 
 
 		 657 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  32 
 
 		 687 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.61 
 
 		 654 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  27.82 
 
 		 738 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  29.29 
 
 		 676 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  26.5 
 
 		 815 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_002620  TC0754  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.774812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>