50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1644 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  100 
 
 		 218 aa  423  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  41.36 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  37.1 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  42.02 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  40.62 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  42.02 
 
 		 187 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  42.02 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  36.79 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  33.86 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  32.68 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1271  colicin V production protein  31.15 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  27.23 
 
 		 193 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  28.29 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  33.55 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  31.79 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  31.79 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  25.15 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  23.98 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  25.75 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  32.46 
 
 		 162 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  24.55 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  27.08 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  26.09 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  30.91 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  28.92 
 
 		 159 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  31.58 
 
 		 162 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  28.95 
 
 		 162 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  26.96 
 
 		 162 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  25.68 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  25.54 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  28.68 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  21.93 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  26.21 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  29.73 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  27.52 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  28.83 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  24.79 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  28.83 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  30 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  28.83 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  27.95 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  27.03 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  21.63 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  27.12 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  28.83 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  28.83 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1046  Colicin V production protein  22.5 
 
 		 180 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  25.3 
 
 		 164 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  27.93 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  19.12 
 
 		 234 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>