More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0728 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  100 
 
 
443 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  29.95 
 
 
447 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  30.11 
 
 
477 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  31.15 
 
 
439 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.79 
 
 
432 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  29.21 
 
 
468 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.34 
 
 
432 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  30.29 
 
 
428 aa  186  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  30 
 
 
430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.93 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  26.13 
 
 
431 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  31.51 
 
 
448 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  28.09 
 
 
469 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  26.86 
 
 
436 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.01 
 
 
451 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.01 
 
 
484 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  27.78 
 
 
426 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.94 
 
 
434 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.6 
 
 
431 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.88 
 
 
441 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.61 
 
 
444 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.84 
 
 
444 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  25 
 
 
431 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.69 
 
 
441 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  24.2 
 
 
420 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.41 
 
 
440 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  27.46 
 
 
435 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.87 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  27.68 
 
 
435 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.81 
 
 
440 aa  153  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.21 
 
 
439 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  29.13 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  27.46 
 
 
435 aa  153  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  27.68 
 
 
435 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  27.68 
 
 
435 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  27.23 
 
 
435 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  27.23 
 
 
435 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  27.23 
 
 
435 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  27.46 
 
 
435 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  27.46 
 
 
441 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  28.07 
 
 
432 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.93 
 
 
442 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  27.23 
 
 
435 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.97 
 
 
448 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  31.19 
 
 
461 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.36 
 
 
449 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  28.24 
 
 
422 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.04 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.17 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  26.97 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  23.9 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  26.02 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  28 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  24.6 
 
 
435 aa  147  3e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.75 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  27.65 
 
 
398 aa  146  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  27.61 
 
 
413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  27.56 
 
 
478 aa  146  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  29.05 
 
 
440 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.54 
 
 
443 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  28.15 
 
 
444 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  29.32 
 
 
461 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  26.14 
 
 
422 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.92 
 
 
442 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  29.22 
 
 
426 aa  142  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  30.05 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  25.5 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2064  amidohydrolase  29.77 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.29 
 
 
443 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  27.47 
 
 
433 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0532  amidohydrolase  25.68 
 
 
427 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1366  amidohydrolase  25.47 
 
 
459 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.376571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.82 
 
 
442 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  26.65 
 
 
663 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.82 
 
 
447 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.83 
 
 
449 aa  139  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  26.2 
 
 
660 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5805  amidohydrolase  29.84 
 
 
488 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.494829  normal  0.718811 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  25.63 
 
 
422 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  29.11 
 
 
416 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  25.58 
 
 
422 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1260  amidohydrolase  25 
 
 
427 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  28.6 
 
 
460 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.19 
 
 
656 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.05 
 
 
439 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0654  amidohydrolase  23.99 
 
 
423 aa  136  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  31 
 
 
483 aa  136  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  25.13 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  28.74 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.16 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  28.85 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.12 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1376  amidohydrolase  24.93 
 
 
427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000571224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  28.85 
 
 
441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  27.03 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  30.11 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.9 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  26.95 
 
 
440 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  27.47 
 
 
449 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  27.08 
 
 
491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>