29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0424 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  63.85 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  46.02 
 
 		 341 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3801  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.53 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  31.8 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  28.41 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  29.85 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  40.4 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  31.53 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  29.41 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  29.91 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  30.49 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  30.49 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.09 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1229  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  24.48 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.27 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.29 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4941  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  24.54 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1601  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.76 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0233634  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.29 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.29 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.75 
 
 		 327 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000682633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>