20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1982 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1982    100 
 
 		 603 bp  1195    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  86.22 
 
 		 792 bp  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  82.96 
 
 		 792 bp  363  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2638a    85.34 
 
 		 141 bp  87.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000719159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4513    85.34 
 
 		 141 bp  87.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000322038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  80.66 
 
 		 789 bp  81.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  79.46 
 
 		 789 bp  79.8  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  80.65 
 
 		 972 bp  69.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1190    84.52 
 
 		 3415 bp  63.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2642    79.19 
 
 		 315 bp  50.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  79.56 
 
 		 795 bp  50.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  100 
 
 		 1470 bp  48.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1973  hypothetical protein  88.64 
 
 		 264 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108643  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3332    88.64 
 
 		 129 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2345  hypothetical protein  88.64 
 
 		 222 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2387  hypothetical protein  88.64 
 
 		 129 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0654736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1246  hypothetical protein  88.64 
 
 		 264 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  93.75 
 
 		 678 bp  48.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2500  hypothetical protein  88.64 
 
 		 264 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1480    88.64 
 
 		 308 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>