13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1603 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  45.49 
 
 
396 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  29.18 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  32.95 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  29.14 
 
 
436 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  37.5 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  29.17 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  35.16 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  32.14 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  36.17 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  33.64 
 
 
161 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  31.31 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.468137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  29.29 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>