19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0444 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0444  hypothetical protein  100 
 
 
51 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  58.33 
 
 
50 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  64 
 
 
52 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  68 
 
 
52 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  68 
 
 
52 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7233  hypothetical protein  93.75 
 
 
51 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  57.14 
 
 
50 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3474  hypothetical protein  87.5 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0167723  normal  0.141558 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4546  hypothetical protein  87.5 
 
 
51 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5022  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105589  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5838  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4341  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3216  hypothetical protein  81.82 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965485  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  56.25 
 
 
51 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5076  hypothetical protein  78.79 
 
 
89 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5276  hypothetical protein  75.76 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2051  hypothetical protein  83.87 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5990  hypothetical protein  74.19 
 
 
52 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2402  hypothetical protein  78.12 
 
 
51 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>