66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2542 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2542    100 
 
 
486 bp  963    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183438  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  87.34 
 
 
1227 bp  77.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  87.34 
 
 
1227 bp  77.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0636    100 
 
 
1149 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0754284 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3279  transposase mutator family protein  88.71 
 
 
1191 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3771    88.71 
 
 
1955 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  88.71 
 
 
1260 bp  67.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  84.81 
 
 
1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1227    84.81 
 
 
1208 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1740    84.81 
 
 
1077 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0731895  normal  0.031178 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  87.3 
 
 
1260 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  84.81 
 
 
1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  84.81 
 
 
1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  87.3 
 
 
1260 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  87.3 
 
 
1260 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  87.3 
 
 
1260 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  84.81 
 
 
1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  84.81 
 
 
1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  84.81 
 
 
1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  84.81 
 
 
1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  87.1 
 
 
1260 bp  60  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2299    87.72 
 
 
512 bp  58  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0127428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  85.94 
 
 
1251 bp  56  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  85.94 
 
 
1251 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0254    85.94 
 
 
2624 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  85.94 
 
 
1251 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  85.94 
 
 
1251 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  85.94 
 
 
1251 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  85.94 
 
 
1251 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  85.94 
 
 
1251 bp  56  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0379    85.71 
 
 
844 bp  54  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  85.71 
 
 
1308 bp  54  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1778  transposase  85.48 
 
 
573 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0428813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  85.48 
 
 
1260 bp  52  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  85.48 
 
 
1260 bp  52  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  85.25 
 
 
1251 bp  50.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  84.62 
 
 
1251 bp  50.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  84.62 
 
 
1251 bp  50.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  85.25 
 
 
1251 bp  50.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  85.25 
 
 
1251 bp  50.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  85.25 
 
 
1251 bp  50.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  85 
 
 
1251 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  85 
 
 
1251 bp  48.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  84.38 
 
 
1251 bp  48.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  87.5 
 
 
1227 bp  48.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1738  transposase mutator family protein  87.23 
 
 
156 bp  46.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0442844  normal  0.0371874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0292  putative transposase, mutator type  89.74 
 
 
1257 bp  46.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  84.13 
 
 
1260 bp  46.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  85.45 
 
 
1260 bp  46.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  85.45 
 
 
1260 bp  46.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  85.45 
 
 
1260 bp  46.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  85.45 
 
 
1260 bp  46.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  84.13 
 
 
1260 bp  46.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5649    87.23 
 
 
309 bp  46.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>