17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2217 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  911    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  63.48 
 
 
455 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  54.72 
 
 
439 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  51.44 
 
 
440 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  51.44 
 
 
424 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  50.24 
 
 
583 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  50.48 
 
 
557 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  51.32 
 
 
377 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  45.22 
 
 
429 aa  363  4e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  37.37 
 
 
373 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  36.69 
 
 
381 aa  203  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  27.5 
 
 
405 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  29.07 
 
 
462 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  27.63 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  26.62 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  25.66 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  21.21 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>