13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7322 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7322  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000508641  hitchhiker  0.000788064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0460  plasmid-related protein  42.68 
 
 
114 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2775  hypothetical protein  37.04 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403791  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3401  hypothetical protein  40.51 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.522628 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0069  hypothetical protein  36.56 
 
 
154 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0127  hypothetical protein  37.37 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112785  hitchhiker  0.0000602842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2323  hypothetical protein  40.26 
 
 
113 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000138331  hitchhiker  0.0000021382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1426  hypothetical protein  38.75 
 
 
113 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0387332  normal  0.841002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1292  hypothetical protein  35.63 
 
 
107 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597741  normal  0.806179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2777  plasmid-related protein  40.24 
 
 
107 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.727317  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5163  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1207  hypothetical protein  35 
 
 
110 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6019  hypothetical protein  25.71 
 
 
274 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0930878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>