11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3401 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3401  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1426  hypothetical protein  85.71 
 
 		 113 aa  184  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0387332  normal  0.841002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1292  hypothetical protein  83.18 
 
 		 107 aa  183  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597741  normal  0.806179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2323  hypothetical protein  82.86 
 
 		 113 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000138331  hitchhiker  0.0000021382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1207  hypothetical protein  67.62 
 
 		 110 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0460  plasmid-related protein  63.54 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0127  hypothetical protein  40.66 
 
 		 262 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112785  hitchhiker  0.0000602842 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7322  hypothetical protein  40.51 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000508641  hitchhiker  0.000788064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2775  hypothetical protein  35.96 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2777  plasmid-related protein  29.25 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.727317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>