15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5497 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 262 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  57.92 
 
 		 263 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  56.76 
 
 		 263 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  48.26 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  48.09 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  40.52 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  38.65 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  40.52 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  39 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  38.62 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  40.32 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  41.67 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  38.59 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  36.73 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>