15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5179 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5179  integrase family protein  100 
 
 		 505 aa  1049    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4986  Phage integrase  64.51 
 
 		 527 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  53.47 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  53.47 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  24.01 
 
 		 526 aa  97.1  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  28.57 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  32.8 
 
 		 342 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  25.47 
 
 		 361 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  25.31 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  25.31 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  25.31 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>