20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0354 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0354  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4368  hypothetical protein  94.12 
 
 
68 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0081  hypothetical protein  74.63 
 
 
66 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0202  hypothetical protein  67.65 
 
 
68 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0399  membrane protein-related protein  66.18 
 
 
97 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2928  hypothetical protein  66.18 
 
 
68 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2161  hypothetical protein  66.18 
 
 
68 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0215  hypothetical protein  66.18 
 
 
68 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3419  hypothetical protein  66.18 
 
 
68 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3126  hypothetical protein  58.82 
 
 
68 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2464  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3078  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3096  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6428  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2989  hypothetical protein  57.35 
 
 
68 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.0284485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3075  hypothetical protein  57.35 
 
 
69 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.233607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1770  membrane protein  36.92 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0396  membrane protein  41.07 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1580  membrane protein  34.33 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1240  membrane protein  42.62 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00603178  normal  0.880519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>