18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2989 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2989  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.0284485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3126  hypothetical protein  98.53 
 
 
68 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6428  hypothetical protein  94.12 
 
 
68 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2464  hypothetical protein  92.65 
 
 
68 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3096  hypothetical protein  92.65 
 
 
68 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712567 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3078  hypothetical protein  92.65 
 
 
68 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3075  hypothetical protein  91.3 
 
 
69 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.233607 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2928  hypothetical protein  79.41 
 
 
68 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2161  hypothetical protein  79.41 
 
 
68 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0399  membrane protein-related protein  79.41 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0215  hypothetical protein  79.41 
 
 
68 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3419  hypothetical protein  79.41 
 
 
68 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0202  hypothetical protein  77.94 
 
 
68 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0081  hypothetical protein  69.12 
 
 
66 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0354  hypothetical protein  57.35 
 
 
68 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4368  hypothetical protein  57.35 
 
 
68 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1580  membrane protein  37.31 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1770  membrane protein  33.93 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>