15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1770 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1770  membrane protein  100 
 
 
69 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1580  membrane protein  56.92 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0396  membrane protein  52.24 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2012  membrane protein  54.1 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0548  hypothetical protein  45.16 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000663046  hitchhiker  0.000215127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4368  hypothetical protein  38.46 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0354  hypothetical protein  36.92 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2464  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3078  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3096  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6428  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0081  hypothetical protein  37.5 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3126  hypothetical protein  33.93 
 
 
68 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3075  hypothetical protein  37.5 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.233607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2989  hypothetical protein  33.93 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.0284485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>