16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1580 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1580  membrane protein  100 
 
 		 69 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1770  membrane protein  56.92 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0396  membrane protein  51.72 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0548  hypothetical protein  41.18 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000663046  hitchhiker  0.000215127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2464  hypothetical protein  38.81 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3078  hypothetical protein  38.81 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3096  hypothetical protein  38.81 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6428  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3126  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2989  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.0284485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3075  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.233607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2012  membrane protein  46.55 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0354  hypothetical protein  34.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.604079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2488  membrane protein  62.32 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.570889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0081  hypothetical protein  34.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4368  hypothetical protein  35.82 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>