21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1240 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1240  membrane protein  100 
 
 		 66 aa  127  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00603178  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4368  hypothetical protein  45.9 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0354  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.604079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6428  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2989  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.0284485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2464  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3078  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3096  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3075  hypothetical protein  42.62 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.233607 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0202  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0399  membrane protein-related protein  40.98 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0215  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3419  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2161  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2928  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3126  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0081  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1580  membrane protein  38.6 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0396  membrane protein  41.07 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2012  membrane protein  44.26 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1770  membrane protein  38.6 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>