18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6825 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  48.3 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  48.26 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  44.87 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  45.08 
 
 
263 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  42.92 
 
 
249 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  35.88 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  42.19 
 
 
250 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  41.15 
 
 
251 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  37.45 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  36.03 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  36.03 
 
 
250 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  37.3 
 
 
250 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  37.19 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  27.78 
 
 
138 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3260  hypothetical protein  55.17 
 
 
142 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  29.91 
 
 
236 aa  42  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>