48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5416 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 388 aa  764    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  57.23 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  59.22 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  56.72 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  56.39 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  55.84 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  50.46 
 
 		 337 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  55.67 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  53.5 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  51.85 
 
 		 332 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  48.32 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  51.92 
 
 		 334 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  46.78 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  43.31 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  42.09 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  39.62 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  38.75 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  41.61 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  39.81 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.64 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  45.58 
 
 		 313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  39.17 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  31.44 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.52 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.11 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.16 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.04 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  30.62 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  28.52 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.72 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.58 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  30.27 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.86 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  37.5 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  36.67 
 
 		 423 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.67 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.67 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0683  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.67 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998366  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  36.36 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  36.36 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  36.36 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.76 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  26.36 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.24 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.94 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0226  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.4 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.597403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.56 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>