23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4094 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  32.92 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  39.58 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  32.28 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  42.64 
 
 
223 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  40.82 
 
 
252 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  38.42 
 
 
247 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  41.67 
 
 
252 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
456 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  41.11 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
441 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  34 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
245 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  33.74 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  32.1 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  35.75 
 
 
169 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  33.98 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3994  hypothetical protein  43.04 
 
 
86 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>