10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0033 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0033    100 
 
 
352 bp  698    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0019    94.12 
 
 
373 bp  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0017    96.55 
 
 
400 bp  50.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0050  tmRNA  96.55 
 
 
365 bp  50.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.720301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0060    96.55 
 
 
358 bp  50.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0045    96.55 
 
 
403 bp  50.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0050    96.55 
 
 
403 bp  50.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0060    96.55 
 
 
403 bp  50.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0014    96.55 
 
 
370 bp  50.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0050    93.75 
 
 
362 bp  48.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>