12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3720 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3720  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  413  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.199556  normal  0.0832499 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7038  hypothetical protein  43.72 
 
 		 281 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4321  hypothetical protein  45.2 
 
 		 313 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0278  hypothetical protein  42.37 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4482  hypothetical protein  42.7 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0219075  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4664  hypothetical protein  43.5 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654345  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4982  hypothetical protein  43.5 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9171  hypothetical protein  41.81 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8098  hypothetical protein  41.81 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4755  hypothetical protein  44.16 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9558  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422586  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5631  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  23.77 
 
 		 904 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>