34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3610 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 76 aa  150  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  72.37 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  69.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  61.84 
 
 		 77 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  61.33 
 
 		 77 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  61.33 
 
 		 77 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  61.84 
 
 		 77 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3976  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  56.76 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4391  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  56.76 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5964  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.41 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.95 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.95 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  52.63 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.27 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.51 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.76 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  29.85 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  42.86 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0933  hypothetical protein  40.32 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0399505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.82 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0889  SpoVT/AbrB-like  36.36 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  35.94 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>