30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3291 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  54.76 
 
 		 48 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  52.38 
 
 		 48 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  52.38 
 
 		 48 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  52.27 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  52.27 
 
 		 48 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  52.27 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  50 
 
 		 46 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  54.35 
 
 		 50 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  45.24 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  43.48 
 
 		 48 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  43.9 
 
 		 48 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  52.5 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  58.33 
 
 		 43 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  45.65 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  45.65 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  42.55 
 
 		 48 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  45.65 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  52.63 
 
 		 50 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  38.3 
 
 		 48 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  41.46 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  41.46 
 
 		 48 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  41.86 
 
 		 48 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  46.94 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  45 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0963  hypothetical protein  44.19 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  47.5 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  45 
 
 		 50 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2374  hypothetical protein  44.74 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.34259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  44.9 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>