25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3176 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  55.84 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  51.9 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  54.22 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  51.9 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  45.68 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  44.32 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  36.78 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0616  hypothetical protein  43.48 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.173694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0417  protein of unknown function DUF497  41.33 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  32.18 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  30.68 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  34.09 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  30.43 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  34.94 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  30.34 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  30.68 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  30.68 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  30.23 
 
 		 92 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>