31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2781 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2781    100 
 
 		 579 bp  1148    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5272    83.61 
 
 		 630 bp  83.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  83.78 
 
 		 960 bp  77.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  83.78 
 
 		 960 bp  77.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  83.78 
 
 		 513 bp  77.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  83.78 
 
 		 960 bp  77.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  83.78 
 
 		 960 bp  77.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  82.79 
 
 		 1392 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  87.32 
 
 		 567 bp  69.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  86.96 
 
 		 966 bp  65.9  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  89.29 
 
 		 666 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    84.34 
 
 		 950 bp  61.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2630    88.68 
 
 		 225 bp  58  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  82.18 
 
 		 336 bp  58  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  83.33 
 
 		 798 bp  56  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 984 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 990 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 462 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  83.78 
 
 		 387 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    83.78 
 
 		 980 bp  52  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 990 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 861 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 990 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  92.11 
 
 		 951 bp  52  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>