39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1808 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  52.07 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  43.1 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  42.06 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  42.45 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  37.5 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  36.73 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  36.72 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  42.86 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  42.86 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  41.09 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  38.93 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  38.14 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  36 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  47.42 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  45.28 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  41.51 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  38.6 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  31.55 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  35.78 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  35.19 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  39.45 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  33.62 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  32.38 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  38.68 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  38.78 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  33.02 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  39.29 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  32.38 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  29.13 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  28.7 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  28.7 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  28.7 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  28.7 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  38.55 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  30.48 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  37.36 
 
 		 359 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  31.68 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  30.93 
 
 		 264 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>