26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0409 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  53.85 
 
 
301 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  54.97 
 
 
300 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  57.89 
 
 
280 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  52.16 
 
 
298 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  54.33 
 
 
298 aa  308  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  52.49 
 
 
300 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  275  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  275  5e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  48.55 
 
 
280 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  45.14 
 
 
280 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  47.64 
 
 
281 aa  244  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  47.74 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  45.19 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  42.16 
 
 
288 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  41.04 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  42.15 
 
 
297 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  39.21 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  38.85 
 
 
276 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  41.63 
 
 
277 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  27.05 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  25.27 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  27.27 
 
 
514 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  23.86 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  23.47 
 
 
552 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  23.13 
 
 
552 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>