19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13280  LSU ribosomal protein L32P  100 
 
 		 56 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0352088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3288  ribosomal protein L32  60 
 
 		 57 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.541236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1558  ribosomal protein L32  61.54 
 
 		 56 aa  67.4  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900428  decreased coverage  0.00889428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4845  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784807  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1886  50S ribosomal protein L32  56.36 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4388  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 57 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4682  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 57 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.32504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4302  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 57 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1386  ribosomal protein L32  52.73 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4160  50S ribosomal protein L32  55.77 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21540  LSU ribosomal protein L32P  53.7 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0096297  hitchhiker  0.000173407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4414  ribosomal protein L32  56.6 
 
 		 53 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000688865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36450  LSU ribosomal protein L32P  61.82 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10997  50S ribosomal protein L32  54.55 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.6896799999999995e-25  normal  0.590269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08890  50S ribosomal protein L32  59.46 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2240  50S ribosomal protein L32  53.49 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000311506 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1040  50S ribosomal protein L32  54.05 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2502  50S ribosomal protein L32  53.49 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.801451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1667  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.294477  normal  0.0177766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>