15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2060 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2060  Flp/Fap pilin component  100 
 
 
93 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0485753  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3925  Flp/Fap pilin component  83.33 
 
 
59 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165585  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3418  Flp/Fap pilin component  83.33 
 
 
59 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2462  Flp/Fap pilin component family protein  51.72 
 
 
63 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.297341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2037  putative fimbriae assembly-related protein  49.15 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1683  hypothetical protein  49.15 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0339  putative fimbriae assembly-related protein  49.15 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1870  Flp/Fap pilin  49.15 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1882  Flp/Fap pilin  49.15 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0822  hypothetical protein  49.15 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0250805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1521  hypothetical protein  36.07 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55940  hypothetical protein  44.07 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175514  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  30.77 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0650  Flp/Fap pilin component  30.59 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4873  hypothetical protein  43.1 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0822533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>