11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6836 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6836  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3829  hypothetical protein  53.92 
 
 
422 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.322751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3335  hypothetical protein  30.26 
 
 
461 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  22.16 
 
 
575 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  28.82 
 
 
858 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  28.82 
 
 
858 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  28.82 
 
 
864 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 
553 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  38.64 
 
 
892 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  23.53 
 
 
552 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.09 
 
 
876 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>