32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3484 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  822    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  42.76 
 
 
371 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  40.67 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  38.14 
 
 
384 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  38.41 
 
 
365 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  37.35 
 
 
373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  36.54 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  34.41 
 
 
372 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  38.33 
 
 
366 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  38.37 
 
 
404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  35.71 
 
 
368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  32.92 
 
 
355 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  33.25 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  35.7 
 
 
375 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  32.05 
 
 
362 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  36.26 
 
 
374 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  33.82 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  33.61 
 
 
366 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  33.81 
 
 
374 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  30.99 
 
 
363 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  27.44 
 
 
367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  32.85 
 
 
374 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  34.32 
 
 
379 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  32.35 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  27.25 
 
 
382 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  28.43 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  30.86 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  31.58 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  28.69 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  26.97 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  24.84 
 
 
342 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  29.63 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>