26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1415 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1415  protein of unknown function DUF437  100 
 
 
178 aa  346  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.849897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  38.64 
 
 
360 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1166  protein of unknown function DUF437  36.99 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.320751  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06553  hypothetical protein  32.26 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0233  hypothetical protein  32.52 
 
 
133 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1901  hypothetical protein  30.16 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.623364  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4712  hypothetical protein  31.96 
 
 
134 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2104  hypothetical protein  32.67 
 
 
130 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223798 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000672  hypothetical protein  28.21 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.11314  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1771  hypothetical protein  35.16 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2538  hypothetical protein  29.08 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1659  hypothetical protein  35.16 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2695  hypothetical protein  29.79 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432251  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1395  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0260  hypothetical protein  25.81 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1005  hypothetical protein  35 
 
 
148 aa  47.8  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000462083  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0928  hypothetical protein  24.8 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.349962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0311  asch domain superfamily  27.56 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35920  hypothetical protein  30.65 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0088  protein of unknown function DUF437  31.15 
 
 
171 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0343  hypothetical protein  26.96 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0385  hypothetical protein  26.96 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0390  hypothetical protein  26.96 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5003  asch domain superfamily  25.2 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0247  hypothetical protein  29.09 
 
 
110 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1042  hypothetical protein  22.05 
 
 
149 aa  42  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>