16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3943 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  530  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  93.51 
 
 		 263 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  57.14 
 
 		 262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  50 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  49.38 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  44.87 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  37.15 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  35.25 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  34.9 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  33.89 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  36.86 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  34.89 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  34.24 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  32.58 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  30.84 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>