More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3239 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3239  aldo/keto reductase  100 
 
 
364 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13922  normal  0.0117807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  88.3 
 
 
323 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42050  putative oxidoreductase  71.43 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  65.28 
 
 
323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  60 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  59.18 
 
 
325 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  57.09 
 
 
325 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  56.09 
 
 
326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  56.36 
 
 
326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  56.72 
 
 
342 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  57.09 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6288  putative oxidoreductase  56.34 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128393  normal  0.0609657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  55.02 
 
 
326 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  54.07 
 
 
326 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  55.47 
 
 
330 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  56.67 
 
 
326 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  54.95 
 
 
331 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  57.2 
 
 
346 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  56.3 
 
 
327 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  54.48 
 
 
326 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  54.72 
 
 
325 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.11 
 
 
331 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0071932  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2388  aldo/keto reductase  53.11 
 
 
331 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  52.38 
 
 
331 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  54.48 
 
 
326 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3237  aldo/keto reductase  52.63 
 
 
326 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  53.7 
 
 
326 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  55.43 
 
 
326 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  53.9 
 
 
326 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  53.16 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  55.22 
 
 
325 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  52.75 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  54.68 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  54.1 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  53.36 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4129  aldo/keto reductase  56.56 
 
 
326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0121527  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  54.65 
 
 
349 aa  281  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  52.42 
 
 
322 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1994  aldo/keto reductase  53.73 
 
 
349 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000673515  normal  0.0830186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  54.51 
 
 
332 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5778  aldo/keto reductase  56.97 
 
 
326 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3842  aldo/keto reductase  56.15 
 
 
326 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4526  aldo/keto reductase  56.15 
 
 
326 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150764  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5167  aldo/keto reductase  53.51 
 
 
326 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  52.99 
 
 
326 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02340  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.08 
 
 
336 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3956  aldo/keto reductase  55.74 
 
 
326 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4628  aldo/keto reductase  52.77 
 
 
326 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5093  aldo/keto reductase  52.77 
 
 
326 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  52.75 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4419  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
326 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2963  aldo/keto reductase  50.92 
 
 
331 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.947943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3336  aldo/keto reductase  52.73 
 
 
326 aa  272  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  59.73 
 
 
326 aa  272  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  51.87 
 
 
326 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  59.28 
 
 
332 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.97 
 
 
324 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  51.49 
 
 
332 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.97 
 
 
324 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  56.36 
 
 
326 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  53.97 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  53.97 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.97 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  53.97 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  53.97 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.57 
 
 
324 aa  269  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0481  putative aryl-alcohol dehydrogenase W  54.37 
 
 
324 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0523  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.37 
 
 
324 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.57 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  52.31 
 
 
322 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  50.37 
 
 
326 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0460  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  56.6 
 
 
324 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0462  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  56.6 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0468  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  56.6 
 
 
324 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  52.29 
 
 
324 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  49.3 
 
 
343 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2826  aldo/keto reductase  47.92 
 
 
340 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2469  aldo/keto reductase  48.51 
 
 
348 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  50.37 
 
 
327 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3381  aldo/keto reductase  54.75 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.24 
 
 
339 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
339 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.24 
 
 
339 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6932  aldo/keto reductase  48.5 
 
 
345 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933917  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  52.21 
 
 
326 aa  243  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  51.52 
 
 
337 aa  242  6e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  51.05 
 
 
324 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_09474  aldo-keto reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11260)  44.21 
 
 
348 aa  241  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266976  normal  0.0773831 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  51.69 
 
 
325 aa  239  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  52.73 
 
 
324 aa  240  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3357  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
326 aa  239  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  48.91 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1005  aldo/keto reductase  44.73 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1969  putative oxidoreductase  44.78 
 
 
326 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365702  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  51.45 
 
 
323 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  53.39 
 
 
335 aa  228  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1164  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
323 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.123786 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02910  aryl-alcohol dehydrogenase, putative  43.94 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.345326  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  47.04 
 
 
339 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>