41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0838 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0838  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4081  hypothetical protein  93.18 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0939  hypothetical protein  93.26 
 
 		 89 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0499  hypothetical protein  89.89 
 
 		 89 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0978  hypothetical protein  89.89 
 
 		 89 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1564  hypothetical protein  80.61 
 
 		 103 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1987  hypothetical protein  83.52 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3039  hypothetical protein  83.52 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2987  hypothetical protein  83.52 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2625  hypothetical protein  83.52 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0793  hypothetical protein  83.52 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2119  hypothetical protein  85.23 
 
 		 88 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3073  hypothetical protein  85.23 
 
 		 88 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2420  hypothetical protein  87.5 
 
 		 88 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0761064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3319  hypothetical protein  79.31 
 
 		 87 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.493809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3645  hypothetical protein  55.68 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4850  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  59.04 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3643  hypothetical protein  53.49 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0278  hypothetical protein  31.82 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2026  hypothetical protein  31.82 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  31.33 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  38.03 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  31.51 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2568  hypothetical protein  35.21 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3107  hypothetical protein  36.21 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1233  hypothetical protein  35.38 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.9486  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0710  hypothetical protein  29.17 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1901  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  30.56 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  26.83 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  32.26 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  28.42 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  32.26 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  32.26 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  27.91 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  32.26 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  31.15 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  30.91 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2082  hypothetical protein  42.22 
 
 		 82 aa  40  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.106415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>