17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4909 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4390  hypothetical protein  99.33 
 
 		 327 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4909  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3399  hypothetical protein  94.95 
 
 		 299 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4968  hypothetical protein  94.95 
 
 		 299 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5318  hypothetical protein  95.29 
 
 		 299 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0966148  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0710  hypothetical protein  94.31 
 
 		 299 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3650  hypothetical protein  93.62 
 
 		 298 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1807  hypothetical protein  84.14 
 
 		 295 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15946  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0914  hypothetical protein  84.72 
 
 		 295 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0821  hypothetical protein  85.07 
 
 		 295 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1294  hypothetical protein  79.06 
 
 		 291 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00319958  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1358  hypothetical protein  78.34 
 
 		 291 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21060  hypothetical protein  62.13 
 
 		 291 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.829076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1797  hypothetical protein  61.76 
 
 		 291 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8732  hypothetical protein  48.12 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13404  normal  0.265431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  23.9 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  26.5 
 
 		 356 aa  42.7  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>