17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4406 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  93.51 
 
 		 263 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  57.92 
 
 		 262 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  50.21 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  50 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  44.87 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  37.15 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  35.02 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  32.95 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  34.73 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  35.86 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  34.9 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  34.51 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  32.95 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  29.17 
 
 		 239 aa  42  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>